ทุกครั้งที่เราเตรียมดิน อาจกล่าวได้เลยว่า “ขาดปุ๋ยคอกไม่ได้” เพราะขั้นตอนของการเตรียมดินทุกครั้ง จะต้องมีการเติมปุ๋ยคอกลงคลุกเคล้ากับดินปลูก โดยปุ๋ยคอกนั้น เราอาจหาซื้อได้ตามร้านเกษตรทั่วไป ซึ่งจะมีทั้งแบบรวม คือ มูลของสัตว์ทุกชนิด และแบบแยกเฉพาะสัตว์บางชนิด เช่น ปุ๋ยขี้วัว ปุ๋ยขี้ไก่ ปุ๋ยขี้เป็ด เป็นต้น ถ้าคุณอยากได้ปุ๋ยคอกที่มีธาตุอาหารสูงๆ คุณควรเลือกปุ๋ยคอก เช่น ขี้ไก่ ขี้หมู หรือขี้ค้างคาว ซึ่งปุ๋ยคอกชนิดนี้จะมีไนโตรเจน ฟอสฟอรัส และโพแทสเซียมสูง แต่พืชผักบางชนิดอาจไม่ชอบดินเค็มมากจนเกินไป เค็มในที่นี้หมายถึงมีธาตุทั้ง 3 ชนิดที่ปริมาณสูงเกินไป ในกรณีเช่นนี้ เราควรเลือกปุ๋ยคอกที่ได้จากขี้วัว หรือขี้ควายแทน
นอกจากนี้ ปุ๋ยคอกยังมีข้อดีที่ปุ๋ยเคมีทั่วไปเทียบไม่ติด ก็คือเรื่องของประสิทธิภาพในการเกื้อกูลกับดินเป็นอย่างดี เนื่องจากในปุ๋ยคอกนั้นอุดมไปด้วยธาตุอาหารรอง เช่น แคลเซียม แมกนีเซียม กำมะถัน และธาตุอาหารเสริม เช่น เหล็ก แมงกานีส สังกะสี ทองแดง โบรอน โมลิบดีนัม และคลอรีน เป็นต้น อีกทั้งยังให้ฮอร์โมนและสารควบคุมการเจริญเติบโตที่จำเป็นต่อพืชอีกด้วย